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簡(jiǎn)要總結

在晚期非小細胞肺癌中ALK融合變異的檢出是ALK-TKI靶向治療的必要條件。目前ALK融合的檢測方法主要有IHC、FISH和NGS，但由于存在A(yíng)LK融合變異頻率較低、腫瘤組織樣本難于獲取以及檢測技術(shù)的局限性而面臨融合檢出的挑戰。研究者在1246例NSCLC病例中比較了RNA-based NGS與IHC和FISH檢測技術(shù)之間的一致性和靈敏度等，發(fā)現RNA-based NGS檢測周期及結果準確性均較好。表明采取RNA-based NGS檢測代替IHC的方法，可以更有效地評估ALK融合狀態(tài)。

背景介紹及結果分析

肺癌仍然是全球癌癥死亡的最常見(jiàn)原因，其中非小細胞肺癌（NSCLC）占80%-85%。 ALK融合變異是NSCLC中常見(jiàn)驅動(dòng)基因突變之一，變異頻率大約在5%-7%左右，因其靶向藥使用時(shí)間長(cháng)，平均生存期也長(cháng)，被稱(chēng)為“鉆石突變”。隨著(zhù)近期阿來(lái)替尼在早期術(shù)后輔助治療的獲批，使得ALK檢測的必要性更加充分。

FISH是檢測重排的“金標準”，但是檢測周期比較耗時(shí)，且需要專(zhuān)門(mén)的儀器設備和對應的專(zhuān)業(yè)知識來(lái)解釋各種信號結果。當面臨腫瘤組織樣本各種問(wèn)題和腫瘤細胞百分比非常低的情況下，一些樣本無(wú)法滿(mǎn)足FISH標準分析。隨著(zhù)高性能單克隆抗體的出現，IHC已逐漸應用于融合變異的檢測。雖然IHC結果更容易解釋?zhuān)膊恍枰馞ISH那樣的專(zhuān)門(mén)設備，且IHC和FISH之間的一致性很高，但依然不能取代FISH的應用。由于技術(shù)問(wèn)題和不同ALK融合變體產(chǎn)生的ALK蛋白活性不同，常規實(shí)踐中有時(shí)會(huì )產(chǎn)生不一致的結果。

NGS可以從既往FISH陰性的樣本中檢出融合變異，且一次可以同步檢測多種可用藥靶點(diǎn)。然而，在常規的臨床實(shí)踐中NGS也存在其不可避免的難題。研究者就三種不同檢測技術(shù)在大樣本量的真實(shí)世界研究中進(jìn)行對比分析，并結合檢測周期進(jìn)行綜合評估。

1246例NSCLC患者進(jìn)行了ALK IHC評估，其中有51例(4%)顯示明確陽(yáng)性，1174例樣本為陰性，同時(shí)有21例樣本為非特異性染色結果。ALK FISH分析結果53例(4.2%)為陽(yáng)性。其中有2例經(jīng)免疫組化檢測為非特異性染色，但通過(guò)RNA-NGS檢測到ALK 5′/3′端表達不平衡，預測為融合變異。RNA-NGS檢出59例（4.7%）為陽(yáng)性。

RNA-NGS檢出的ALK融合變異中，92%為EML4-ALK，同時(shí)還有DCTN1-ALK、KIF5B-ALK、STRN-ALK以及融合伴侶不詳的5′/3′表達不平衡融合。

圖1.RNA-NGS檢出的ALK融合類(lèi)型

59例NGS分析結果為陽(yáng)性的樣本中，有53例(89.8%)例經(jīng)驗證為FISH陽(yáng)性，51例為IHC陽(yáng)性。NGS檢測出的9例ALK 5'/3'端表達不平衡的樣本中有6例經(jīng)過(guò)FISH和IHC檢測均為陰性，提示其為NGS假陽(yáng)性樣本。

 圖2.NGS、FISH、IHC檢測ALK融合的結果分布情況

在ROC曲線(xiàn)分析中，當免疫組化分值為145時(shí)，RNA-NGS相比于IHC在檢測ALK融合的特異性為98.99%，靈敏度為100%，NPV（陰性預測值）為100%，PPV（陽(yáng)性預測值）為98.04%。

研究者還結合了報告周期的評估，該研究調研范圍內NGS報告的平均周期為4天（3-8天），ALK IHC報告平均耗時(shí)2天(2 - 5天)，ALK FISH報告平均耗時(shí)13天(6 - 21天)。

本研究結論

該研究通過(guò)分析RNA-NGS與IHC在A(yíng)LK融合檢測中的靈敏度與特異性，并結合檢測周期綜合評估（例如，對于IHC結果不太確定需要進(jìn)行FISH驗證時(shí)，總體檢測周期無(wú)疑再次被拉長(cháng)，且檢測成本升高，病理實(shí)驗室工作量加大，且對于少量活檢或腫瘤細胞含量低的樣本增加其消耗），建議使用RNA-NGS做為******進(jìn)行ALK融合狀態(tài)的檢測。然而，在NGS結果不確定的情況下，或者在特定情況下，如年輕和/或非吸煙者患者，或根據醫生的特定要求，也可考慮ALK FISH。

參考文獻

Ilié, M.; Goffinet, S.; Rignol, G.; Lespinet-Fabre, V.; Lalvée, S.; Bordone, O.; Zahaf, K.; Bonnetaud, C.; Washetine, K.; Lassalle, S.; et al. Shifting from Immunohistochemistry to Screen for ALK Rearrangements: Real-World Experience in a Large Single-Center Cohort of Patients with Non-Small-Cell Lung Cancer. Cancers 2024, 16, 2219. https://doi.org/ 10.3390/cancers16122219

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